La ubiquitinación es una modificación post-traduccional crucial que implica la unión covalente de ubiquitina (una pequeña proteína de 76 aminoácidos) a los residuos de lisina de las proteínas objetivo, lo cual es catalizado por ligasas de ubiquitina. Se ha demostrado que esta modificación regula casi todos los aspectos de la biología vegetal, incluyendo el crecimiento, el desarrollo y las respuestas a estrés abiótico y biótico. El virus del fruto rugoso marrón del tomate (ToBRFV), un tobámovirus emergente, ha sido detectado en más de cincuenta países en todo el mundo. Sin embargo, el impacto global de la infección por ToBRFV en los perfiles de ubiquitinación de proteínas huésped sigue siendo en gran medida inexplorado. En este estudio, realizamos un análisis integrado de ubiquitinomics y proteómica para identificar proteínas ubiquitinadas diferencialmente tras la infección por ToBRFV. Nuestros hallazgos proporcionan una base valiosa para la caracterización adicional de los genes de las plantas involucrados funcionalmente en las interacciones huésped-ToBRFV.