Proporcionamos una visión general completa de las variaciones de secuencia en los genomas de ganado Xiangnan con importantes implicaciones para el futuro. El ganado Xiangnan, una raza de ganado nativa de China, está adaptado a un clima cálido y húmedo. En este estudio, realizamos una comparación genómica de 16 genomas de ganado Xiangnan con otras poblaciones/razas globales para evaluar la diversidad genética, identificar regiones genómicas candidatas y revelar la introgressión de banteng/gaur en el ganado Xiangnan. Nuestros resultados revelan las características genómicas únicas del ganado Xiangnan en entornos de alta temperatura y alta humedad, lo que proporciona valiosos conocimientos para futuras investigaciones y conservación de razas, y es importante para enriquecer el acervo genético de la cría de ganado doméstico.