Junto con el rápido desarrollo de la acuicultura de recirculación de alta densidad, la agricultura industrial intensiva se ha vuelto generalizada en la industria acuícola. Sin embargo, el estrés crónico por hacinamiento inducido por la agricultura industrial intensiva puede llevar a un crecimiento retardado de los peces, inmunidad suprimida y comportamiento anormal. Aunque numerosos estudios han explorado las causas de los efectos negativos inducidos por el estrés por hacinamiento, se ha descuidado el papel del cerebro, que es el órgano sensorial principal y regulador central de los estresores. En este estudio, se han explorado los perfiles de expresión de ARN de todo el transcriptoma en el telencéfalo y el hipotálamo de la lubina de boca ancha bajo estrés crónico por hacinamiento, proporcionando nuevas perspectivas sobre los mecanismos de respuesta del cerebro ante el estrés por hacinamiento. Además, estos hallazgos facilitan el desarrollo de estrategias de mitigación basadas en la neurociencia.