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Análisis transcriptómico comparativo de la piel y la capa de la pared peritoneal de distribuido en altas elevaciones

Autores: Ma, Li; Zhu, Zhen; Zhang, Shanzhong; Yang, Ruibin; Liu, Chen; Yu, Yongyao; Yang, Xuefen

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 7

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Un total de 81,868 All-Unigenes fueron secuenciados y ensamblados por el transcriptoma en la piel dorsal, la piel lateral y la capa de la pared peritoneal, con una longitud total de ensamblaje de 123,827,585 pb, y 68,750 unigenes fueron anotados en siete bases de datos funcionales. Se seleccionaron un total de 588 DEGs entre la piel dorsal y la piel lateral, 17,097 DEGs entre la piel dorsal y la capa de la pared peritoneal, y 16,598 DEGs entre la piel lateral y la capa de la pared peritoneal. La mayoría de los DEGs en los tres tejidos fueron anotados en términos de GO relacionados con estructuras celulares, unión, procesos celulares y actividad catalítica. También fueron anotados en vías de KEGG como la vía de señalización MAPK, la vía de señalización PI3K-Akt, la vía de señalización Wnt, la melanogénesis, el metabolismo de la tirosina y el ciclo celular. Se encontró que un total de veintitrés DEGs estaban enriquecidos en la vía de síntesis de melanina mediante una comparación local de Blast, de los cuales nueve DEGs estaban significativamente regulados al alza en la capa de la pared peritoneal y seis DEGs estaban significativamente regulados al alza en la piel dorsal y lateral. Los resultados sugieren que estos genes pueden estar asociados con el mecanismo molecular de la síntesis de melanina, y la regulación diferencial de los genes puede estar relacionada con las diferencias en la intensidad de UVR y los sitios de tejido de síntesis de melanina. Se necesita una investigación adicional sobre cómo estos genes regulan específicamente la síntesis de melanina.

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