Detección de Variaciones en el Número de Copias en Poblaciones de Woori-Heukdon con el Array de Bead-Chip Illumina PorcineSNP60
Autores: Kim, Yong-Min; Seong, Ha-Seung; Ha, Seok-Joo; Kim, Young-Sin; Kim, Jae-Kwon; Baek, Heejung; Kwon, Seona; Yoon, Sangwon; Lee, Joon-Hee; Seo, Dongwon; Chung, Won-Hyong; Hong, Joon-Ki; Choi, Jung-Woo; Cho, Eun-Seok
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Variaciones en el número de copias
Cnvs
Especies de ganado
Proceso de cruzamiento
Wrh
Qtls
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 5
Citaciones: Sin citaciones
Las variaciones en el número de copias (CNVs) son segmentos de ADN que varían en número entre individuos o poblaciones. Los CNVs pueden influir potencialmente en varios rasgos de interés en especies de ganado, como el crecimiento, la reproducción y la calidad de la carne. Woori-Heukdon (WRH) se desarrolló a través de un proceso de cruce, utilizando principalmente Duroc coreano (DUC) y cerdo nativo coreano (KNP). Esto implicó cruzar DUC y KNP para producir la generación F, retrocruzar DUC con F para generar F, y posteriormente criar F con F para producir WRH. Aquí, utilizamos el software PennCNV v1.0.5 y QuantiSNP v2.3 para identificar CNVs en los genomas de WRH, sus razas parentales (DUC y KNP) y generaciones intermedias (F y F). Los resultados revelaron patrones de CNV distintos en esas poblaciones, con las regiones de CNV de WRH (CNVRs) mostrando la mayor superposición con los loci de rasgos cuantitativos (QTLs) relacionados con el aumento diario promedio (ADG). Esto sugiere que los rasgos de rápido crecimiento de DUC se han incorporado a WRH a través del cruce. Además, los QTLs que se superponen con los CNVRs en WRH también incluían algunos relacionados con rasgos de calidad de la carne, lo que indica contribuciones de KNP. Estos hallazgos destacan las variaciones genómicas asociadas con el desarrollo de WRH y proporcionan valiosos conocimientos para programas de cría destinados a mejorar rasgos económicamente importantes en cerdos.
Descripción
Las variaciones en el número de copias (CNVs) son segmentos de ADN que varían en número entre individuos o poblaciones. Los CNVs pueden influir potencialmente en varios rasgos de interés en especies de ganado, como el crecimiento, la reproducción y la calidad de la carne. Woori-Heukdon (WRH) se desarrolló a través de un proceso de cruce, utilizando principalmente Duroc coreano (DUC) y cerdo nativo coreano (KNP). Esto implicó cruzar DUC y KNP para producir la generación F, retrocruzar DUC con F para generar F, y posteriormente criar F con F para producir WRH. Aquí, utilizamos el software PennCNV v1.0.5 y QuantiSNP v2.3 para identificar CNVs en los genomas de WRH, sus razas parentales (DUC y KNP) y generaciones intermedias (F y F). Los resultados revelaron patrones de CNV distintos en esas poblaciones, con las regiones de CNV de WRH (CNVRs) mostrando la mayor superposición con los loci de rasgos cuantitativos (QTLs) relacionados con el aumento diario promedio (ADG). Esto sugiere que los rasgos de rápido crecimiento de DUC se han incorporado a WRH a través del cruce. Además, los QTLs que se superponen con los CNVRs en WRH también incluían algunos relacionados con rasgos de calidad de la carne, lo que indica contribuciones de KNP. Estos hallazgos destacan las variaciones genómicas asociadas con el desarrollo de WRH y proporcionan valiosos conocimientos para programas de cría destinados a mejorar rasgos económicamente importantes en cerdos.