Las enfermedades neurodegenerativas son trastornos complejos que, en la mayoría de los casos, surgen de la interacción entre la susceptibilidad genética y los factores de riesgo ambientales. En este contexto, los mecanismos epigenéticos son cruciales en la patogénesis de las enfermedades neurodegenerativas, mediando los efectos de los factores ambientales sobre la funcionalidad adecuada del genoma. El sexo es una variable importante en la modulación del riesgo de desarrollar enfermedades neurodegenerativas e influye en su curso clínico. Aunque está bien establecido que los mecanismos epigenéticos también son influenciados por el sexo, las diferencias epigenéticas entre mujeres y hombres afectados por enfermedades neurodegenerativas siguen siendo poco investigadas. Esta revisión resume la evidencia clave de alteraciones epigenéticas específicas por sexo en las principales enfermedades neurodegenerativas, incluyendo la enfermedad de Alzheimer, la enfermedad de Parkinson y la esclerosis lateral amiotrófica. Dada la creciente importancia de la medicina de género en el tratamiento de enfermedades humanas, una comprensión más profunda de los mecanismos epigenéticos específicos por sexo es altamente relevante para las enfermedades neurodegenerativas.