El objetivo de la investigación es caracterizar la reflectancia espectral superficial de las aguas costeras utilizando el código de corrección atmosférica Tafkaa para la recuperación de las concentraciones de constituyentes marinos a partir de datos hiperespectrales. El área de estudio son las aguas costeras de Nueva York/Nueva Jersey, consideradas como un recurso ecológico, económico y recreativo valioso dentro del área metropolitana de Nueva York. La comparación de la radiancia medida por el Espectrómetro de Imágenes Infrarrojas Visibles Aerotransportado (AVIRIS) y la medición de reflectancia in situ muestra el efecto de la fuente solar y la atmósfera en la radiancia espectral total ascendente medida por AVIRIS. Se aplicó el código de transferencia radiativa, Tafkaa, para eliminar los efectos de la atmósfera y generar una reflectancia precisa (R(0)) a partir de la radiancia de AVIRIS para recuperar parámetros de calidad del agua (es decir, clorofila total). La estimación de clorofila como índice de abundancia de fitoplancton se optimizó utilizando la relación de bandas de AVIRIS a 675 nm y 702 nm, resultando en un coeficiente de determinación de R2 = 0.98. El uso del código de transferencia radiativa junto con el modelo bioóptico es la herramienta principal para utilizar la teledetección del color del océano como una herramienta operativa para el monitoreo de las comunidades ecológicas costeras clave de fitoplancton importantes en estudios de cambio global.