Los álamos son árboles de rápido crecimiento y son importantes tanto ecológica como industrialmente. Existen variaciones en la capacidad de enraizamiento entre los clones de álamo de la misma especie, lo que impacta significativamente la tasa de éxito de la propagación por esquejes. Seleccionamos clones de especies de álamo híbrido que mostraron un alto o bajo crecimiento de raíces y estudiamos su actividad genética durante 3 semanas después del corte del tallo. El grupo con mayor capacidad de enraizamiento exhibió raíces más largas y grandes, así como una mayor expresión de genes relacionados con hormonas vegetales, desarrollo de la pared celular y compuestos naturales como los flavonoides, en comparación con el grupo con menor capacidad de enraizamiento. Los genes asociados con la producción de flavonoides pueden desempeñar papeles clave en el desarrollo de raíces. Se espera que estos resultados mejoren nuestra comprensión de los genes clave y las vías biológicas involucradas en el enraizamiento del álamo y contribuyan a la selección de clones de álamo con una eficiencia de enraizamiento superior para la propagación vegetativa por esquejes.