El uso de cultivos de servicio (cubierta) se practica ampliamente en la agricultura del suelo debido a sus muchos beneficios, que incluyen un suministro mejorado de nutrientes y una mejor salud del suelo. Las bacterias, como principales descomponedores de los residuos vegetales en el suelo, desempeñan roles esenciales en el ciclo de nutrientes. Este estudio examinó el impacto de diversas prácticas de manejo de huertos de almendros en la composición de la comunidad microbiana del suelo en un ecosistema hiperárido. Se utilizó secuenciación de alto rendimiento para comparar las comunidades microbianas en dos huertos de almendros adyacentes gestionados con prácticas de agricultura orgánica (ORG) o regenerativa (RA), junto con un sitio no cultivado (UC). Notablemente, se sabe poco sobre las respuestas de las comunidades bacterianas del suelo en regiones hiperáridas al acolchado de cultivos de servicio. Este estudio puede ofrecer información sobre los límites ecológicos de los beneficios de los cultivos de servicio en la promoción de la salud del suelo en condiciones extremas. Nuestros hallazgos demuestran que la gestión RA puede alterar los niveles de carbono orgánico del suelo y remodelar las comunidades microbianas al aumentar la abundancia bacteriana general y enriquecer taxones clave específicos. Estos cambios pueden tener implicaciones significativas para los procesos de ciclo de nutrientes en agroecosistemas hiperáridos.