La protección de los Territorios Indígenas - TI en el estado de Maranhão, ubicado en la región noreste de Brasil, representa un gran desafío en la intersección de la conservación ambiental y los derechos territoriales. Situado entre los biomas de la Amazonía y el Cerrado y dentro de la frontera agrícola de MATOPIBA, el estado enfrenta presiones antropogénicas crecientes que aceleran los cambios en el uso de la tierra, intensifican los regímenes de incendios y aumentan las emisiones de gases de efecto invernadero. Este estudio evaluó las dinámicas temporales del uso de la tierra y la cobertura terrestre y su relación con el fuego en Territorios Indígenas oficialmente reconocidos desde 1985 hasta 2023 utilizando teledetección, geoprocesamiento y análisis espacial en Google Earth Engine. Los Territorios Indígenas perdieron 185,327 ha de vegetación nativa, de las cuales el 66.9% correspondió a bosques y el 33.1% a sabanas, pero aún retuvieron 2028.755 ha en 2023, con un 81.2% clasificado como bosque. La recurrencia de incendios alcanzó hasta 37 eventos por píxel, siendo Araribóia, Kanela y Porquinhos dos Canela Apãnjekra los que exhibieron las frecuencias más altas. Durante el fenómeno de El Niño de 2015-2016, Araribóia registró el mayor episodio de incendios, con 200,652 ha quemadas (48.5%). Entre 2013 y 2023, las emisiones totales de gases de efecto invernadero alcanzaron aproximadamente 709 Mt CO2eq, con un 85% originado de incendios y un 15% de la deforestación. Los hallazgos destacan la necesidad de integrar el conocimiento tradicional, la gobernanza territorial y las estrategias de Manejo Integrado del Fuego para fortalecer la protección de los Territorios Indígenas y apoyar la preservación de los medios de vida indígenas en Maranhão.