Los perros mapache han sido criados con fines económicos durante aproximadamente 100 años, y los perros mapache blancos se encuentran entre las razas más famosas de perros mapache criados. Sin embargo, los perros mapache blancos son más débiles en términos de aptitud que los perros mapache normales. El objetivo de los criadores es eliminar mutaciones potencialmente perjudiciales mientras se mantiene un pelaje blanco. Por primera vez, realizamos la secuenciación del genoma completo de una población de perros mapache blancos y llevamos a cabo un análisis comparativo con perros mapache normales. Encontramos un tamaño efectivo de población más pequeño para los perros mapache blancos en los últimos 100 años. La endogamia general en los dos tipos de perros mapache resultó ser muy similar, pero se encontró que la endogamia reciente era más extensa en los perros mapache blancos. Curiosamente, el número total de mutaciones perjudiciales en los perros mapache blancos es comparable al de los perros mapache normales. Sin embargo, la proporción de mutaciones de sentido erróneo homocigotas en los perros mapache blancos es mayor que en los perros mapache normales, lo que indica que la acumulación de mutaciones perjudiciales de pequeño efecto puede ser facilitada durante el desarrollo de razas blancas.