La rápida urbanización ha provocado una carga de nutrientes, lo que inevitablemente conducirá a la eutrofización de los cuerpos de agua y afectará aún más la estructura de las poblaciones acuáticas. En la actualidad, la eutrofización es un desafío significativo para los ecosistemas acuáticos urbanos. Sin embargo, aún sabemos poco sobre la correlación entre la eutrofización en los ríos urbanos y la composición de los grupos funcionales acuáticos. Se investigaron los efectos de la eutrofización de los ríos urbanos en las comunidades de rotíferos mediante una encuesta de campo anual en el tramo de Jinan del río Xiaoqing, un río urbano típico en el norte de China. Utilizando la diversidad funcional (FD) y la diversidad beta, se investigó la variación espaciotemporal del régimen de grupos funcionales biológicos acuáticos a lo largo de tramos sujetos a diferentes niveles de eutrofización. La uniformidad funcional (FEve) y la divergencia funcional (FDiv) disminuyeron significativamente con el incremento del índice de nivel trófico. La diversidad funcional exhibe un nivel extremadamente bajo entre los grupos funcionales, siendo la diferencia de riqueza (RichDiff) un componente importante. Los resultados indican que la eutrofización llevó a la homogeneización de las comunidades de rotíferos. Esto puede atribuirse a la homogeneización funcional de la comunidad de rotíferos en el tramo de Jinan del río Xiaoqing. La homogeneización observada puede deberse a especies ampliamente distribuidas que complementan el espacio del nicho ecológico. Nuestros hallazgos proporcionan información valiosa sobre la conservación del río urbano bajo la amenaza de la eutrofización causada por actividades humanas de alta intensidad.