Este estudio analizó la contaminación microbiana en la carne de cordero y durante su proceso de sacrificio en cuatro puntos de venta en Coimbatore, centrándose en la carga microbiana total y la prevalencia de patógenos específicos. Se recolectaron muestras de carne de cordero, tablas de cortar, hisopos de mano, cuchillos, balanzas de pesaje y agua. El agua lavada de cordero y la carne de cordero mostraron las cargas microbianas más altas, particularmente en términos de recuento total de placas y coliformes. Las especies eran comunes, con la identificación automatizada revelando que la mayoría de los patógenos eran de origen. Se detectó en el 57% de las muestras de cordero utilizando un sistema de identificación automatizado. El análisis de cromatografía de gases y espectrometría de masas de carne de cabra inoculada con patógenos identificó perfiles volátiles y de metabolitos distintos, proporcionando posibles biomarcadores para la contaminación. El análisis estadístico multivariante diferenciaba aún más los perfiles volátiles y de metabolitos. Estos hallazgos subrayan la importancia de la contaminación cruzada durante el manejo de la carne y sugieren el uso de compuestos volátiles para la detección de patógenos.