Identificación a Nivel Genómico y Análisis Evolutivo de la Familia de Proteínas de Unión a ARN que Contienen el Dominio YTH y el Papel de GhYTH8 en Respuesta al Estrés por Sequía
Autores: Hao, Wei; Wang, Weipeng; Xiao, Xiangfen; Sun, Jialiang; Wu, Bingjie; Zhao, Yuping; Pei, Shuaishuai; Fan, Wenjia; Xu, Dongbei; Qin, Tengfei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Proteína de unión a ARN
Proteínas que contienen dominio YTH
Regulación post-transcripcional
Respuestas al estrés abiótico
Algodón
Tolerancia a la sequía
Licencia
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Citaciones: Sin citaciones
Las proteínas que contienen el dominio YTH son un tipo de proteína que se une al ARN y están involucradas en la regulación post-transcripcional, desempeñando múltiples roles en la regulación del crecimiento, desarrollo y respuestas a estrés abiótico en las plantas. Sin embargo, la familia de proteínas que se unen al ARN con dominio YTH no ha sido estudiada previamente en el algodón. En este estudio, se identificaron un total de 10, 11, 22 y 21 genes en , , , y , respectivamente. Estos genes fueron categorizados en tres subgrupos mediante análisis filogenético. Se analizaron la distribución cromosómica, el análisis de sinonimia, las estructuras de los genes y los motivos de las proteínas YTH. Además, se caracterizó el elemento -del promotor de los genes, los objetivos de miARN de los genes y la localización subcelular de GhYTH8 y GhYTH16. También se analizaron los patrones de expresión de los genes en diferentes tejidos, órganos y en respuesta a diferentes estrés. Además, las verificaciones funcionales revelaron que el silenciamiento atenuó la tolerancia a la sequía en la línea de algodón de tierras altas TM-1. Estos hallazgos proporcionan pistas útiles para el análisis funcional y evolutivo de los genes en el algodón.
Descripción
Las proteínas que contienen el dominio YTH son un tipo de proteína que se une al ARN y están involucradas en la regulación post-transcripcional, desempeñando múltiples roles en la regulación del crecimiento, desarrollo y respuestas a estrés abiótico en las plantas. Sin embargo, la familia de proteínas que se unen al ARN con dominio YTH no ha sido estudiada previamente en el algodón. En este estudio, se identificaron un total de 10, 11, 22 y 21 genes en , , , y , respectivamente. Estos genes fueron categorizados en tres subgrupos mediante análisis filogenético. Se analizaron la distribución cromosómica, el análisis de sinonimia, las estructuras de los genes y los motivos de las proteínas YTH. Además, se caracterizó el elemento -del promotor de los genes, los objetivos de miARN de los genes y la localización subcelular de GhYTH8 y GhYTH16. También se analizaron los patrones de expresión de los genes en diferentes tejidos, órganos y en respuesta a diferentes estrés. Además, las verificaciones funcionales revelaron que el silenciamiento atenuó la tolerancia a la sequía en la línea de algodón de tierras altas TM-1. Estos hallazgos proporcionan pistas útiles para el análisis funcional y evolutivo de los genes en el algodón.