Este estudio investiga las vías de innovación institucional para integrar redes de transporte integrales en el sistema de planificación espacial territorial de China, con un enfoque en resolver los conflictos entre la conservación ecológica y el desarrollo de infraestructuras. Al proponer un marco de "restricción-acoplamiento-innovación", esta investigación aborda las brechas en los mecanismos de gobernanza espacial existentes, particularmente la insuficiente alineación entre la planificación del transporte y el sistema de "tres zonas y tres líneas" (zonas de conservación ecológica, producción agrícola y desarrollo urbano con línea roja vinculante). El estudio emplea enfoques de métodos mixtos, incluyendo análisis de conflictos geoespaciales (SIG), herramientas de coordinación de políticas impulsadas por IA y estudios de caso de la Franja Económica del Río Yangtsé. Demuestra que las restricciones ecológicas rígidas (por ejemplo, el poder de veto de sensibilidad ecológica) pueden reducir efectivamente los conflictos de planificación, mientras que los modelos de gobernanza adaptativa mejoran la eficiencia del uso del suelo y la colaboración de las partes interesadas. Los hallazgos clave revelan una correlación negativa significativa (R2 = 0.75) entre la cobertura de la línea roja de protección ecológica (EPR) y la densidad de la red de transporte, subrayando la necesidad de estrategias de gobernanza diferenciadas en regiones de alto conflicto. Un análisis comparativo con los sitios Natura 2000 de la UE y las redes TEN-T destaca aún más el modelo de gobernanza jerárquico único de China, que integra mandatos ecológicos de arriba hacia abajo con innovaciones tecnológicas localizadas, como gemelos digitales y toma de decisiones policéntrica. Este estudio contribuye a los debates globales sobre la planificación espacial sostenible al ofrecer vías prácticas para equilibrar la expansión de infraestructuras con la resiliencia ecológica, al tiempo que propone reformas institucionales, como un Índice Nacional de Gobernanza Espacial del Transporte (NTSGI), para estandarizar el cumplimiento ecológico. Estas ideas proporcionan tanto avances teóricos en el institucionalismo espacial como herramientas prácticas para los responsables de políticas que navegan por los desafíos duales de la urbanización y la resiliencia climática.