La microbiota intestinal es un sistema complejo que desempeña un papel peculiar en la regulación de la inmunidad innata y sistémica. Cada vez hay más evidencia que vincula la microbiota intestinal disfuncional con la enfermedad del hígado graso asociada a disfunción metabólica (MASLD) debido a la activación de múltiples vías en el intestino y en el hígado, incluidas las mediadas por receptores tipo Toll (TLRs), que sostienen la inflamación hepática. Así, se han realizado muchos esfuerzos para desentrañar el papel de la disfunción asociada a la microbiota en la MASLD, con el objetivo final de encontrar nuevas estrategias para mejorar la esteatosis hepática y la función. Además, la evidencia reciente subraya el papel del tejido adiposo en el sostenimiento de la inflamación hepática durante el desarrollo de la MASLD. En esta revisión, nos centramos en las estrategias recientemente descubiertas propuestas para mejorar la alteración de la microbiota intestinal observada en pacientes con MASLD, con una atención particular a aquellas conocidas por modular la disfunción asociada a la microbiota intestinal y afectar la compleja interacción entre el intestino, el tejido adiposo y el hígado.