En los lagos eutróficos, incluso si la carga externa se controla, la carga interna de nutrientes retrasa la recuperación de la eutrofización del lago. Cuando se reduce la entrada de contaminantes externos, el ambiente de oxígeno disuelto en la interfaz de sedimentos mejora en una temporada sin floraciones algales. Como parte importante de los ecosistemas lacustres, los macroinvertebrados son sensibles a la hipoxia causada por la eutrofización; sin embargo, cómo este cambio afecta a los macroinvertebrados aún se desconoce. En este estudio, analizamos los datos de monitoreo del lago Taihu del norte desde 2007 hasta 2019. Después de 2007, la carga externa del lago Taihu fue relativamente estable, pero la eutrofización comenzó a intensificarse después de 2013, y los nutrientes en los sedimentos también comenzaron a disminuir, lo que estaba relacionado con el uso eficiente de nutrientes por las floraciones algales. La estructura de la comunidad y la densidad poblacional de los macroinvertebrados mostraron diferentes respuestas en diferentes etapas. En particular, la densidad de oligoquetos y el índice de Shannon-Wiener mostraron diferencias significativas en su respuesta a diferentes etapas, y su sensibilidad a la eutrofización se redujo significativamente. En condiciones de eutrofización dominadas por la carga interna, la hipoxia frecuente ocurre en la interfaz de sedimentos solo cuando estalla una floración algal. Cuando no hay floración, la probabilidad de hipoxia en los sedimentos se reduce significativamente bajo la perturbación del viento. Nuestros resultados indican que el método actual para evaluar la eutrofización del lago basado en oligoquetos y el índice de diversidad de Shannon-Wiener puede perder su sensibilidad.