La artritis idiopática juvenil (AIJ) representa la artritis crónica pediátrica más común en los países occidentales y una de las principales causas de discapacidad en niños. A pesar de los logros clínicos recientes, la gestión de los pacientes sigue viéndose obstaculizada por la falta de biomarcadores diagnósticos/prognósticos y protocolos de tratamiento dirigidos. Los microARN (miARN) son ARN cortos no codificantes que desempeñan un papel clave en la regulación génica, y su participación en muchas patologías ha sido ampliamente reportada en la literatura. En las últimas décadas, se ha demostrado la contribución de los miARN a la regulación del sistema inmunológico y la patogénesis de enfermedades autoinmunes. Además, los miARN aislados de muestras biológicas de pacientes están actualmente bajo investigación por su potencial como nuevos biomarcadores. Esta revisión tiene como objetivo proporcionar una visión general del estado del arte en la investigación de miARN en la AIJ. Se revisó la literatura que aborda la expresión de miARN en diferentes tipos de muestras biológicas aisladas de pacientes con AIJ, centrándose en particular en su posible aplicación como biomarcadores diagnósticos/prognósticos. También se discutirá el papel de los miARN en la regulación de las respuestas inmunitarias en las articulaciones afectadas, junto con su posible utilidad como marcadores de las respuestas de los pacientes a los enfoques terapéuticos. Esta información será valiosa para los investigadores en el campo de la reumatología pediátrica, fomentando una mayor investigación para aumentar nuestro conocimiento sobre el potencial de los miARN para futuras aplicaciones clínicas en la AIJ.