Las ocurrencias de inundaciones extremas son cada vez más comunes debido al cambio climático global, siendo las ciudades costeras más vulnerables a desastres de inundación compuestos. Además de la precipitación excesiva y el caudal de los ríos aguas arriba, la marea de tormenta puede complicar el proceso de desastre por inundación y aumentar el riesgo de inundaciones urbanas. Este estudio propuso un enfoque integrado de modelado estadístico y hidrodinámico tridimensional para evaluar el riesgo de inundación compuesto asociado con marejadas extremas, eventos de precipitación y caudal de ríos aguas arriba. Se utilizaron un modelo conjunto de cópula tridimensional innovador y el método de amplificación de frecuencia para simular valores diseñados bajo diferentes períodos de retorno (PR), considerando la correlación de los tres factores. Los resultados muestran diferencias notables entre las áreas inundadas de eventos de inundación con conductores tridimensionales y un solo conductor bajo los mismos PR, lo que indica que los valores de frecuencia univariados son insuficientes para gestionar las amenazas de inundación en eventos de inundación compuestos. El método propuesto proporciona pautas para comprender el proceso de inundación compuesto y diseñar proyectos de control de inundaciones en ciudades costeras.