El panel de firmas de microARN identifica a los bebedores excesivos con cirrosis asociada al alcohol de los bebedores excesivos sin lesión hepática
Autores: Shihana, Fathima; Joglekar, Mugdha V.; Schwantes-An, Tae-Hwi; Hardikar, Anandwardhan A.; Seth, Devanshi
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 6
Citaciones: Sin citaciones
La enfermedad hepática asociada al alcohol (EHA) es el trastorno más común del consumo prolongado de alcohol. Los mecanismos subyacentes a la cirrosis en estos pacientes siguen siendo poco claros. Los microARN juegan un papel regulador en varias enfermedades, se ven afectados por el alcohol y pueden ser jugadores importantes en los trastornos por consumo de alcohol, como la cirrosis. Investigamos muestras de suero de consumidores crónicos de alcohol pesado (80 g/día (hombres) y 50 g/día (mujeres) durante >=10 años) que estaban disponibles de nuestro estudio previamente reportado GenomALC. Se incluyó un subconjunto de bebedores de GenomALC con cirrosis hepática (casos, n = 24) y aquellos sin enfermedad hepática significativa (controles de bebida, n = 23). Se realizó un perfil global de microARN utilizando PCR cuantitativa en tiempo real de alto rendimiento para identificar las firmas de microARN asociadas con la cirrosis. Se utilizó el software Ingenuity Pathway Analysis (IPA) para identificar los mARN objetivo de los microARN significativamente alterados, y se analizaron las vías moleculares. Los microARN identificados se analizaron en relación con biomarcadores tradicionales de enfermedad hepática y variantes de genes de riesgo reportadas previamente en el estudio de asociación del genoma completo de GenomALC. La expresión de 21 microARN se reguló significativamente a la baja en los casos en comparación con los controles de bebida (< 0.05, deltadeltaCt > 1.5 veces). Siete microARN (miR-16, miR-19a, miR-27a, miR-29b, miR-101, miR-130a y miR-191) tuvieron una correlación altamente significativa (< 0.001) con INR, bilirrubina y puntaje MELD. Tres microARN (miR-27a, miR-130a y miR-191) predijeron significativamente los casos con AUC-ROC de 0.8, 0.78 y 0.85, respectivamente (< 0.020); sin embargo, INR tuvo el mejor rendimiento (0.97, < 0.001). Un conjunto diferente de seis microARN (miR-19a, miR-26a, miR-101, miR-151-3p, miR-221 y miR-301) mostró una correlación positiva (que varió de 0.32 a 0.51, < 0.05) con rs10433937: variante de gen asociada con el riesgo de cirrosis. El análisis de IPA reveló los mARN objetivo de los microARN significativamente alterados asociados con la muerte celular/necrósis, fibrosis y aumento de esteatosis, particularmente el metabolismo de triglicéridos. Las firmas de microARN en bebedores distinguieron a aquellos con cirrosis hepática de los bebedores sin enfermedad hepática. Identificamos mARN objetivo en funciones hepáticas que estaban enriquecidas para vías de patogénesis de enfermedades.
Descripción
La enfermedad hepática asociada al alcohol (EHA) es el trastorno más común del consumo prolongado de alcohol. Los mecanismos subyacentes a la cirrosis en estos pacientes siguen siendo poco claros. Los microARN juegan un papel regulador en varias enfermedades, se ven afectados por el alcohol y pueden ser jugadores importantes en los trastornos por consumo de alcohol, como la cirrosis. Investigamos muestras de suero de consumidores crónicos de alcohol pesado (80 g/día (hombres) y 50 g/día (mujeres) durante >=10 años) que estaban disponibles de nuestro estudio previamente reportado GenomALC. Se incluyó un subconjunto de bebedores de GenomALC con cirrosis hepática (casos, n = 24) y aquellos sin enfermedad hepática significativa (controles de bebida, n = 23). Se realizó un perfil global de microARN utilizando PCR cuantitativa en tiempo real de alto rendimiento para identificar las firmas de microARN asociadas con la cirrosis. Se utilizó el software Ingenuity Pathway Analysis (IPA) para identificar los mARN objetivo de los microARN significativamente alterados, y se analizaron las vías moleculares. Los microARN identificados se analizaron en relación con biomarcadores tradicionales de enfermedad hepática y variantes de genes de riesgo reportadas previamente en el estudio de asociación del genoma completo de GenomALC. La expresión de 21 microARN se reguló significativamente a la baja en los casos en comparación con los controles de bebida (< 0.05, deltadeltaCt > 1.5 veces). Siete microARN (miR-16, miR-19a, miR-27a, miR-29b, miR-101, miR-130a y miR-191) tuvieron una correlación altamente significativa (< 0.001) con INR, bilirrubina y puntaje MELD. Tres microARN (miR-27a, miR-130a y miR-191) predijeron significativamente los casos con AUC-ROC de 0.8, 0.78 y 0.85, respectivamente (< 0.020); sin embargo, INR tuvo el mejor rendimiento (0.97, < 0.001). Un conjunto diferente de seis microARN (miR-19a, miR-26a, miR-101, miR-151-3p, miR-221 y miR-301) mostró una correlación positiva (que varió de 0.32 a 0.51, < 0.05) con rs10433937: variante de gen asociada con el riesgo de cirrosis. El análisis de IPA reveló los mARN objetivo de los microARN significativamente alterados asociados con la muerte celular/necrósis, fibrosis y aumento de esteatosis, particularmente el metabolismo de triglicéridos. Las firmas de microARN en bebedores distinguieron a aquellos con cirrosis hepática de los bebedores sin enfermedad hepática. Identificamos mARN objetivo en funciones hepáticas que estaban enriquecidas para vías de patogénesis de enfermedades.