Predicción Solo de Secuencia de Super-Enhancers en Líneas Celulares Humanas Usando Modelos de Transformadores
Autores: Kravchuk, Ekaterina V.; Ashniev, German A.; Gladkova, Marina G.; Orlov, Alexey V.; Zaitseva, Zoia G.; Malkerov, Juri A.; Orlova, Natalia N.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 2
Citaciones: Sin citaciones
Esta investigación se centra en la aplicación de modelos de transformadores avanzados para la predicción de superpotenciadores en líneas celulares humanas únicamente a partir de datos de secuencia de ADN. Al aplicar el modelo de transformador GENA-LM, se logró una diferenciación efectiva entre superpotenciadores y potenciadores en múltiples líneas celulares en comparación con las técnicas utilizadas anteriormente. El enfoque sugiere el procesamiento de secuencias sin ninguna información adicional sobre el paisaje epigenético dentro de la aplicación de un modelo ajustado para la tarea de clasificación de potenciadores/superpotenciadores.
Descripción
Esta investigación se centra en la aplicación de modelos de transformadores avanzados para la predicción de superpotenciadores en líneas celulares humanas únicamente a partir de datos de secuencia de ADN. Al aplicar el modelo de transformador GENA-LM, se logró una diferenciación efectiva entre superpotenciadores y potenciadores en múltiples líneas celulares en comparación con las técnicas utilizadas anteriormente. El enfoque sugiere el procesamiento de secuencias sin ninguna información adicional sobre el paisaje epigenético dentro de la aplicación de un modelo ajustado para la tarea de clasificación de potenciadores/superpotenciadores.