Análisis proteómico y fosfoproteómico revela una respuesta inmune diferencial a la infección por Hirame Novirhabdovirus (HIRRV) en el lenguado () bajo diferentes temperaturas
Autores: Tang, Xiaoqian; Zhang, Yingfeng; Xing, Jing; Sheng, Xiuzhen; Chi, Heng; Zhan, Wenbin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Licencia
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Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
El hirame novirhabdovirus (HIRRV) es uno de los patógenos virales más serios que causa pérdidas económicas significativas en la industria de la acuicultura de lenguado. Estudios previos han demostrado que el brote de HIRRV es altamente dependiente de la temperatura y revelaron que la replicación viral se ve significativamente afectada por la respuesta antiviral de los lenguados a diferentes temperaturas. En el presente estudio, se utilizó el proteoma y el fosfoproteoma para analizar las diferentes respuestas antivirales en el lenguado infectado por HIRRV a 10 grados C y 20 grados C. Después de la infección viral, se identificaron 472 proteínas expresadas diferencialmente (PEDs) en el bazo del lenguado a 10 grados C, que estaban relacionadas con la vía de señalización de receptores tipo NOD, la vía de señalización de receptores tipo RIG-I, el transporte de ARN, entre otros. A 20 grados C, se identificaron 652 PEDs que estaban involucradas en la adhesión focal, la regulación del citoesqueleto de actina, el fagosoma, la vía de señalización de receptores tipo NOD y la vía de señalización de receptores tipo RIG-I. El análisis del fosfoproteoma mostró que se identificaron 675 fosfoproteínas expresadas diferencialmente (PEPDs) en el bazo infectado por el virus a 10 grados C y se enriquecieron significativamente en el espliceosoma, la vía de señalización, la necroptosis y el transporte de ARN. A 20 grados C, se identificaron 1304 PEPDs que se enriquecieron significativamente en el proteasoma, la vía de señalización de VEGF, la apoptosis, el espliceosoma, la vía de señalización de mTOR, la vía de vigilancia de ARN y el transporte de ARN. Cabe destacar que las proteínas y fosfoproteínas involucradas en la producción y señalización de interferón mostraron aumentos significativos en el lenguado infectado por el virus a 20 grados C en comparación con las de 10 grados C. Además, se detectaron los perfiles de expresión temporal de ocho ARNm seleccionados relacionados con la antiviralidad, incluyendo IRF3, IRF7, IKKbeta, TBK1, IFIT1, IFI44, MX1 e ISG15 mediante qRT-PCR, que mostraron una respuesta significativamente más fuerte en las primeras etapas de la infección a 20 grados C. Estos resultados proporcionaron recursos fundamentales para investigaciones posteriores en profundidad sobre el mecanismo de infección por HIRRV y la inmunidad antiviral del lenguado, y también brindan evidencias sobre la alta mortalidad del lenguado infectado por HIRRV a bajas temperaturas.
Descripción
El hirame novirhabdovirus (HIRRV) es uno de los patógenos virales más serios que causa pérdidas económicas significativas en la industria de la acuicultura de lenguado. Estudios previos han demostrado que el brote de HIRRV es altamente dependiente de la temperatura y revelaron que la replicación viral se ve significativamente afectada por la respuesta antiviral de los lenguados a diferentes temperaturas. En el presente estudio, se utilizó el proteoma y el fosfoproteoma para analizar las diferentes respuestas antivirales en el lenguado infectado por HIRRV a 10 grados C y 20 grados C. Después de la infección viral, se identificaron 472 proteínas expresadas diferencialmente (PEDs) en el bazo del lenguado a 10 grados C, que estaban relacionadas con la vía de señalización de receptores tipo NOD, la vía de señalización de receptores tipo RIG-I, el transporte de ARN, entre otros. A 20 grados C, se identificaron 652 PEDs que estaban involucradas en la adhesión focal, la regulación del citoesqueleto de actina, el fagosoma, la vía de señalización de receptores tipo NOD y la vía de señalización de receptores tipo RIG-I. El análisis del fosfoproteoma mostró que se identificaron 675 fosfoproteínas expresadas diferencialmente (PEPDs) en el bazo infectado por el virus a 10 grados C y se enriquecieron significativamente en el espliceosoma, la vía de señalización, la necroptosis y el transporte de ARN. A 20 grados C, se identificaron 1304 PEPDs que se enriquecieron significativamente en el proteasoma, la vía de señalización de VEGF, la apoptosis, el espliceosoma, la vía de señalización de mTOR, la vía de vigilancia de ARN y el transporte de ARN. Cabe destacar que las proteínas y fosfoproteínas involucradas en la producción y señalización de interferón mostraron aumentos significativos en el lenguado infectado por el virus a 20 grados C en comparación con las de 10 grados C. Además, se detectaron los perfiles de expresión temporal de ocho ARNm seleccionados relacionados con la antiviralidad, incluyendo IRF3, IRF7, IKKbeta, TBK1, IFIT1, IFI44, MX1 e ISG15 mediante qRT-PCR, que mostraron una respuesta significativamente más fuerte en las primeras etapas de la infección a 20 grados C. Estos resultados proporcionaron recursos fundamentales para investigaciones posteriores en profundidad sobre el mecanismo de infección por HIRRV y la inmunidad antiviral del lenguado, y también brindan evidencias sobre la alta mortalidad del lenguado infectado por HIRRV a bajas temperaturas.