El cobre (Cu) es un micronutriente esencial para las cianobacterias, participando en importantes procesos celulares como la fotosíntesis. Sin embargo, a concentraciones elevadas, el Cu se vuelve tóxico para estos organismos. Esta dualidad ha llevado a la hipótesis de que el Cu podría servir como un algaecida efectivo para controlar las floraciones de cianobacterias en ambientes acuáticos. Las cianobacterias poseen varios mecanismos celulares para la absorción de Cu, la homeostasis y la detoxificación. A pesar de los recientes esfuerzos de investigación, muchos de estos mecanismos siguen siendo incompletamente comprendidos, y los resultados disponibles están fragmentados en la literatura. Esta revisión tiene como objetivo compilar y analizar el conocimiento actual sobre la absorción de Cu requerida para la función celular y las respuestas de detoxificación al exceso de cobre ambiental, centrándose particularmente en los mecanismos de extrusión de Cu. Estos conocimientos pueden contribuir al desarrollo de estrategias basadas en Cu para la gestión de floraciones de cianobacterias, así como al uso de la bioremediación de cianobacterias en entornos contaminados con Cu.