Una visión general actualizada de las bases de datos de cáncer existentes y las necesidades identificadas
Autores: Austin, Brittany K.; Firooz, Ali; Valafar, Homayoun; Blenda, Anna V.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 2
Citaciones: Sin citaciones
Nuestra búsqueda de bases de datos de cáncer existentes tenía como objetivo evaluar el panorama actual e identificar necesidades clave. Analizamos 71 bases de datos, centrándonos en genómica, proteómica, lipidómica y glicómica. Encontramos una falta de bases de datos lipidómicas y glicómicas relacionadas con el cáncer, lo que indica la necesidad de un mayor desarrollo en estas áreas. Las bases de datos proteómicas dedicadas a la investigación del cáncer también eran limitadas. Para evaluar el progreso general, incluimos bases de datos humanas no relacionadas con el cáncer en proteómica, lipidómica y glicómica para comparación. Esto proporcionó información sobre los avances en estos campos durante los últimos ocho años. También analizamos otros tipos de bases de datos de cáncer, como bases de datos de ensayos clínicos y servidores web. Al evaluar la facilidad de uso, utilizamos el principio de FAIRness para evaluar la encontrabilidad, accesibilidad, interoperabilidad y reutilización. Esto aseguró que las bases de datos fueran fácilmente accesibles y utilizables. Nuestro resumen de búsqueda destaca un crecimiento significativo en las bases de datos de cáncer mientras identifica brechas y necesidades. Estos conocimientos son valiosos para investigadores, clínicos y desarrolladores de bases de datos, guiando los esfuerzos para mejorar la accesibilidad, integración y usabilidad. Abordar estas necesidades apoyará los avances en la investigación del cáncer y beneficiará a la comunidad del cáncer en general.
Descripción
Nuestra búsqueda de bases de datos de cáncer existentes tenía como objetivo evaluar el panorama actual e identificar necesidades clave. Analizamos 71 bases de datos, centrándonos en genómica, proteómica, lipidómica y glicómica. Encontramos una falta de bases de datos lipidómicas y glicómicas relacionadas con el cáncer, lo que indica la necesidad de un mayor desarrollo en estas áreas. Las bases de datos proteómicas dedicadas a la investigación del cáncer también eran limitadas. Para evaluar el progreso general, incluimos bases de datos humanas no relacionadas con el cáncer en proteómica, lipidómica y glicómica para comparación. Esto proporcionó información sobre los avances en estos campos durante los últimos ocho años. También analizamos otros tipos de bases de datos de cáncer, como bases de datos de ensayos clínicos y servidores web. Al evaluar la facilidad de uso, utilizamos el principio de FAIRness para evaluar la encontrabilidad, accesibilidad, interoperabilidad y reutilización. Esto aseguró que las bases de datos fueran fácilmente accesibles y utilizables. Nuestro resumen de búsqueda destaca un crecimiento significativo en las bases de datos de cáncer mientras identifica brechas y necesidades. Estos conocimientos son valiosos para investigadores, clínicos y desarrolladores de bases de datos, guiando los esfuerzos para mejorar la accesibilidad, integración y usabilidad. Abordar estas necesidades apoyará los avances en la investigación del cáncer y beneficiará a la comunidad del cáncer en general.