El ADN tumoral circulante (ctDNA) facilita el estudio longitudinal del genoma tumoral, que, a diferencia de las biopsias de tejido tumoral, refleja globalmente la heterogeneidad intratumoral e intermetastásica. A pesar de sus costos, la secuenciación de nueva generación (NGS) ha revolucionado el estudio del ctDNA, asegurando un enfoque más completo y multimodal, aumentando la recolección de datos e introduciendo nuevas variables que pueden correlacionarse con los resultados clínicos. Las estrategias actuales de NGS pueden incluir un conjunto de genes informado por el tumor o el genoma completo y detectar una fracción tumoral tan baja como el 10. A pesar de algunos estudios contradictorios, hay evidencia de que los niveles de ctDNA pueden predecir peores resultados en el cáncer de ovario (OC) tanto en enfermedad temprana como avanzada. Los cambios en esos niveles también pueden ser informativos respecto a la eficacia del tratamiento y la recurrencia tumoral, capaces de superar al CA-125, actualmente el único biomarcador plasmático utilizado universalmente en el OC seroso de alto grado (HGSOC). La evaluación cualitativa de la secuenciación muestra que el aumento de las alteraciones en el número de copias y las variantes genéticas durante el tratamiento pueden correlacionarse con un peor pronóstico en HGSOC. Sin embargo, seguir la clonalidad tumoral y las variantes emergentes durante el tratamiento presenta una oportunidad más única para definir la respuesta al tratamiento, seleccionar pacientes en función de sus mecanismos de resistencia emergentes, como las mutaciones secundarias de BRCA, y descubrir variantes potencialmente tratables. La secuenciación de biopsias tumorales y ctDNA no siempre es concordante, probablemente como resultado de la heterogeneidad clonal, que se captura mejor en las muestras de plasma que en un gran número de biopsias. Estas incoherencias pueden reflejar la clonalidad tumoral y revelar las alteraciones adquiridas que causan resistencia al tratamiento. Los perfiles de metilación del ADN libre de células pueden utilizarse para distinguir el OC de individuos sanos, y se ha demostrado que los paneles de metilación de NGS tienen excelentes capacidades diagnósticas. Además, las firmas de metilación mostraron promesas al explicar las respuestas al tratamiento, incluida la disfunción de BRCA. El ctDNA está evolucionando como un nuevo biomarcador prometedor para rastrear la evolución tumoral y la clonalidad a través del tratamiento del cáncer de ovario temprano y avanzado, con una aplicabilidad potencial en la predicción pronóstica y la selección de tratamientos. Si bien su papel en HGSOC allana el camino hacia la aplicabilidad clínica, su interés potencial en otros subtipos histológicos de OC sigue siendo desconocido.