Estudios recientes sobre comunidades microbianas en montículos de termitas se han centrado más en bacterias y hongos, prestando poca atención a las arqueas, que desempeñan roles significativos en el ciclo de nutrientes. Así, nuestro objetivo fue caracterizar la diversidad taxonómica y funcional de las arqueas en dos suelos de montículos de termitas utilizando el método de secuenciación shotgun, con la suposición de que las actividades de las termitas podrían promover la diversidad de arqueas. Nuestros hallazgos mostraron que los suelos de montículos de termitas tienen grupos de arqueas que son taxonómicamente diferentes de sus suelos circundantes, siendo predominantes , , y mientras que y eran predominantes en los suelos circundantes. Además, las rutas de nutrientes observadas: fósforo, nitrógeno y azufre fueron todas significativamente más predominantes en los suelos de montículos de termitas que en sus suelos circundantes comparativos. La diversidad alfa mostró que las arqueas no eran significativamente diferentes dentro de los suelos de montículos de termitas y los suelos circundantes. La diversidad beta reveló diferencias significativas en la composición taxonómica de las arqueas y sus categorías funcionales entre los montículos de termitas y los suelos circundantes. Nuestro análisis de correspondencia canónica reveló que la distribución de las comunidades de arqueas probablemente dependía de las propiedades del suelo. Nuestros resultados sugirieron que las actividades de las termitas pueden promover la diversidad de arqueas; con algunas de nuestras secuencias agrupadas como arqueas no clasificadas, hay una necesidad de más investigación para desvelar su identidad.