Se han reportado anomalías congénitas en animales, incluidas anomalías del labio y la mandíbula hendido y la hipospadia, en todas las especies domesticadas. Son una gran preocupación para los criadores debido a la mayor pérdida económica que conllevan. En este artículo, describimos una cheilognatosquisis bilateral congénita (labio y mandíbula hendido) con campilognatia en asociación con hipospadia peneana e hipoplasia prepucial con fallo de fusión prepucial en un ternero mestizo de Piedmontese x Wagyu. Se realizaron exámenes clínicos, tomografía computarizada y secuenciación del genoma completo para describir e identificar una posible causa de las anomalías. El examen clínico reveló una cheilognatosquisis bilateral de aproximadamente 4 cm de longitud y 3 cm de ancho en la parte más ancha, con análisis de tomografía computarizada que confirmaron la ausencia bilateral del proceso nasal del hueso incisivo y la desviación lateral del proceso palatino hacia el lado izquierdo. Los análisis de datos genómicos identificaron 13 mutaciones con un alto impacto en los productos de los siguientes genes superpuestos: , , , , , , , , , , , , y con , , , , y teniendo mutaciones en estado homocigoto. La investigación del genoma completo indica la participación de múltiples genes en los defectos de nacimiento observados en este caso.