Aunque los mecanismos moleculares subyacentes a los fenotipos del síndrome de Down (SD) siguen siendo desconocidos, la caracterización de los genes y las secuencias no génicas conservadas de HSA21, junto con estudios de expresión génica a gran escala en tejidos con SD, están mejorando nuestra comprensión de este complejo trastorno. Además, los modelos murinos de SD proporcionan herramientas invaluables para correlacionar genes o segmentos cromosómicos con fenotipos específicos. En este artículo, analizamos la posible contribución de los genes HSA21 al SD y los datos de estudios globales de expresión génica en muestras trisómicas.