La diversidad genética de las variedades de cebada desnuda (var.) de Tíbet, incluyendo tipos tradicionales (T), modernos (M) y de banco de recursos de germoplasma (G), se evaluó mediante el análisis de huellas moleculares SSR. Los resultados muestran una diversidad genética significativa, particularmente en las variedades T que contienen un mayor número de alelos privados (únicos). Los análisis de coordenadas principales y STRUCTURE revelan una considerable desviación de las variedades M respecto a las variedades T/G. La evidencia de mezcla de semillas en las variedades M sugiere el uso de semillas mezcladas en las prácticas de cultivo contemporáneas. El análisis de clúster indica además que las variedades M tienen un fondo genético más estrecho, probablemente debido al número limitado de variedades T o G que se utilizaron en el mejoramiento de la cebada desnuda. Las relaciones entre los aumentos en la diversidad genética y los tamaños de muestra destacan la importancia de estrategias de muestreo efectivas para las colecciones de campo de variedades de cebada desnuda.