Art韈ulo: Offline Next Generation Metagenomics Sequence Analysis Using MinION Detection Software (MINDS) - Biblioteca virtual VirtualPro.co

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Art韈ulo

Offline Next Generation Metagenomics Sequence Analysis Using MinION Detection Software (MINDS)An醠isis de secuencias metagen髆icas de nueva generaci髇 offline a trav閟 del software de detecci髇 MinION (MINDS)

Resumen

Con el propósito de facilitar el análisis de datos y evitar problemas logísticos causados por fallas de conexiona internet, los autores de este artículo han desarrollado un paquete de análisis de datos independiente utilizando herramientas de código abierto desarrolladas por la comunidad Nanopore que no depende de la disponibilidad de Internet. El software de detección offline MINDS se basa en el motor de clasificación Centrifuge para la identificación rápida de especies. Es una red de clasificación offline en tiempo real que utiliza herramientas de acceso abierto desarrolladas por la comunidad Nanopore y que ha sido probada en 20 cepas ATCC; a través del Kit de secuenciación (SQK-RAD004) fue posible identificar los 20 microorganismos a nivel de especie. Esta aplicación es una opción efectiva, económica y rápida para el análisis de muestras en campo especialmente en locaciones remotas.

  • Tipo de documento:
  • Formato:pdf
  • Idioma:Ingl閟
  • Tama駉:2558 Kb

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Informaci髇 del documento

  • Titulo:Offline Next Generation Metagenomics Sequence Analysis Using MinION Detection Software (MINDS)
  • Autor:Deshpande, Samir V.; Reed, Timothy M.; Sullivan, Raymond F.; Kerkhof, Lee J.; Beigel, Keith M.; Wade, Mary M.
  • Tipo:Art韈ulo
  • A駉:2013
  • Idioma:Ingl閟
  • Editor:

    MDPI

  • Materias:Microbiolog韆
  • Descarga:1

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