Resumen

El análisis filogenético se ha vuelto esencial para investigar las relaciones evolutivas entre los virus. Estas relaciones se representan en árboles filogenéticos, en los que los virus se agrupan en función de la similitud de sus secuencias. Las relaciones evolutivas de los virus se identifican a partir de marcos de lectura abiertos y no de secuencias completas. Recientemente, la computación en nube se ha hecho popular para desarrollar herramientas bioinformáticas basadas en Internet. Biocloud es un servicio de computación bioinformática eficiente, escalable y robusto. En este artículo, proponemos un servicio de análisis filogenético de marcos de lectura abiertos basado en la nube. El servicio propuesto integra el marco Hadoop, la tecnología de virtualización y los métodos de análisis filogenético para proporcionar un bioservicio a gran escala y de alta disponibilidad. En un estudio de caso, analizamos las relaciones filogenéticas entre Norovirus. Las relaciones evolutivas se dilucidan alineando diferentes secuencias de marcos de lectura abiertos. La plataforma propuesta identifica correctamente las relaciones evolutivas entre los miembros de Norovirus.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genómica Polimorfismo genético Proteómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Genomics Genetic polymorphism Proteomics Computational biology
• Palabras claves:relaciones evolutivas, diferentes secuencias de marco de lectura abierto, servicio informático bioinformático robusto, relaciones evolutivas virales, marco de lectura abierto, marcos de lectura abiertos, métodos de análisis filogenético, servicio de análisis filogenético, Norovirus, virus
• Keywords:evolutionary relationships, different open reading frame sequences, robust bioinformatics computing service, Viral evolutionary relationships, open reading frame, open reading frames, phylogenetic analysis methods, phylogenetic analysis service, Norovirus, viruses