Resumen

Pantoea vagans, una bacteria gramnegativa del género Pantoea y la familia Enterobacteriaceae, está presente en diversos entornos naturales y se considera endófita de las plantas. Aislamos la cepa Pantoea vagans PV989 de la clínica y secuenciamos su genoma completo. Además de una molécula cromosómica de ADN, también albergaba tres grandes plásmidos. Se llevó a cabo un análisis genómico comparativo del plásmido más pequeño, pPV989-94. Este plásmido puede dividirse en cuatro regiones. Puede dividirse en cuatro regiones, incluidas tres regiones conservadoras relacionadas con la replicación (R1), la conjugación de transferencia (R2) y la conducción de transferencia (R3), y una región variable (R4). Otros análisis mostraron que pPV989-94 es más similar a los plásmidos LA637P2 y pEA68 de cepas de Erwinia amylovora aisladas de árboles frutales. Estos tres plásmidos comparten tres regiones conservativas (R1, R2 y R3). Curiosamente, un fragmento (R4′) en R4, mediado por la fago integrasa y la recombinasa específica de sitio de la familia de las fago integrasas y que codifica 9 genes relacionados con el glucometabolismo, la resistencia y la reparación del ADN, era único en pPV989-94. Se encontraron homólogos de R4′ en otros plásmidos o cromosomas, lo que sugiere que se produjo una transferencia horizontal de genes (HGT) entre diferentes bacterias de varias especies o géneros. Los genes funcionales adquiridos pueden desempeñar un papel importante en la adaptación de las bacterias a diferentes huéspedes o condiciones ambientales.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Biogenesis Plant genetics Genomics
• Palabras claves:pPV989, regiones conservadoras, cepa de Pantoea vagans PV989, sitio de la familia de las integrasas de fagos, cepas de Erwinia amylovora, molécula de ADN cromosómica, análisis genómico comparativo, transferencia horizontal de genes, diversos entornos naturales, reparación del ADN.
• Keywords:pPV989, conservative regions, Pantoea vagans PV989 strain, phage integrase family site, Erwinia amylovora strains, chromosome DNA molecule, comparative genomics analysis, horizontal gene transfer, various natural environments, DNA repair