Las ciencias ómicas y las nuevas tecnologías para secuenciar genomas completos proporcionan datos valiosos que sólo se revelan tras realizar un análisis bioinformático detallado. En este trabajo analizamos los genomas de siete cepas mexicanas de Anaplasma marginale y los datos de un análisis del transcriptoma de la garrapata Rhipicephalus microplus. El objetivo de este análisis fue identificar secuencias proteicas con características predichas para ser utilizadas como objetivos potenciales para controlar la bacteria o la transmisión garrapata-vector. Elegimos tres secuencias de aminoácidos diferentes a todas las proteínas previamente reportadas en A. marginale que han sido utilizadas como potenciales candidatas a vacunas, y además, reportamos, por primera vez, la presencia de una secuencia de proteína peroxinectina en el transcriptoma de R. microplus, una proteína asociada a la respuesta inmune de las garrapatas. Los análisis bioinformáticos revelaron la presencia de epítopos de células B en todas las secuencias de aminoácidos elegidas, lo que abre la vía a su probable utilización como péptidos únicos o dispuestos para desarrollar nuevas estrategias de control y prevención de la anaplasmosis bovina transmitida por garrapatas.
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