La formación de un enlace covalente entre dos citosinas apiladas, una de las cuales es excitada por un pulso láser ultrarrápido, se estudió mediante simulaciones de dinámica semiclásica. Los resultados muestran que se crea un excimer enlazado, que reduce drásticamente la brecha energética entre el LUMO y el HOMO y, en consecuencia, facilita la desactivación de la molécula excitada electrónicamente. Esto difiere del caso de dos adeninas apiladas, en el que la formación de un enlace covalente altera el mecanismo de desactivación no adiabático de dos formas opuestas. Por un lado, reduce la brecha energética y, en consecuencia, provoca el acoplamiento entre los niveles HOMO y LUMO, potenciando así la desactivación de la molécula electrónicamente excitada. Por otro lado, conduce a la restricción de la vibración de deformación de la pirimidina en la molécula excitada, debido a un efecto estérico, y esto retrasa el proceso de desactivación de la molécula de adenina excitada con el retorno al estado básico electrónico.
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