Resumen

Se ha caracterizado la región específica del macho en el cromosoma Y de la trucha arco iris, que contiene tanto sdY (el gen que determina el sexo) como el marcador genético específico del macho, OmyY1. Se examinaron varios clones que contenían el marcador OmyY1 a partir de una biblioteca BAC de una línea clonal YY y se descubrió que formaban parte de un contig BAC de 800 kb. Mediante hibridación fluorescente in situ (FISH), estos clones se localizaron en el extremo del brazo corto del cromosoma Y en la trucha arco iris, con una señal adicional en el extremo del cromosoma X en muchas células. Secuenciamos una ruta de mosaico mínima de estos clones utilizando Illumina y pirosecuenciación 454. La región es rica en transposones y ADNr, pero también parece contener varios genes codificadores de proteínas de una sola copia. La mayoría de estos genes también se encuentran en el cromosoma X; y en varios casos se identificaron SNP específicos del sexo en estos genes entre las líneas clonales homocigóticas masculinas (YY) y femeninas (XX). Se identificaron genes adicionales mediante la hibridación de los BAC con la micromatriz cGRASP 4x44K oligo de salmónidos. Mediante evaluaciones BLASTn utilizando transcripciones hipotéticas de genes candidatos ligados a OmyY1 como consulta contra varias bases de datos EST, concluimos que al menos 12 de estos genes candidatos son probablemente funcionales, y se expresan.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genómica Polimorfismo genético Proteómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Genomics Genetic polymorphism Proteomics Computational biology
• Palabras claves:genes, macho, cromosoma X, cromosoma Y, genes candidatos, trucha arco iris, K oligo microarray, líneas clonales homocigóticas, kb BAC contig, recorrido mínimo en mosaico
• Keywords:genes, male, X chromosome, Y chromosome, candidate genes, rainbow trout, K oligo microarray, homozygous clonal lines, kb BAC contig, minimum tiling path