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Characterization of the mRNA untranslated regions UTR of the Trypanosoma cruzi LYT1 isoforms derived by alternative trans-splicingCaracterización de las regiones no traducidas de ARNm UTR de las isoformas LYT1 de Trypanosoma cruzi derivadas por empalme trans alternativo

Resumen

En los trypanosomátidos, la expresión génica se regula principalmente en el nivel post-transcripcional mediante mecanismos basados en la interacción entre las proteínas de unión del ARN [RBP] y las figuras presentes en las regiones no traducidas [UTR] de las ARN, que en conjunto forman complejos ribonucleoproteicos [RNP] que definen el destino de la ARN. El pre-ARN derivado del gen LYT1 del Trypanosoma cruzi es procesado por trans-empalme alternativo, dando como resultado diferentes ARN que codifican las isoformas mLYT1 y kLYT1, proteínas con expresión diferencial, localización celular y función. El objetivo de este estudio fue caracterizar los 5´ y 3´ UTR de las ARN LYT1 como el paso inicial hacia la identificación de los RPB responsables de la expresión diferencial. Se confirmó la presencia de los dos tipos de 5´ UTR en dos aislantes del T. cruzi pertenecientes al DTU I; de esta forma también se comprobó la ocurrencia del trans-empalme alternativo en el gen LYT1 de este T. cruzi DTU. Además, por primera vez, se pudo demostrar la existencia de dos tipos de transcripciones de ARN LYT1, que difieren en longitud por 116 nts, y son generadas por poliadenilación alternativa. Adicionalmente, se realizó un análisis in-silico de la UTR obtenida experimentalmente, y otras diez secuencias LYT1 recuperadas de las bases de datos TritrypDB y GenBank, junto con una búsqueda exhaustiva de figuras estructuradas, mostrando una notable conservación de los figuras estructurales asociadas con el metabolismo del ARN en los diferentes UTR; estos elementos podrían estar implicados en la expresión diferenciada de la etapa específica de cada isoforma LYT1.

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Información del documento

  • Titulo:Characterization of the mRNA untranslated regions UTR of the Trypanosoma cruzi LYT1 isoforms derived by alternative trans-splicing
  • Autor:Casas, Julián Camilo; Ospina, María Isabel; Puerta, Concepción J; Ramírez, César Augusto; Requena, José María; Ruiz, Elizabeth
  • Tipo:Artículo
  • Año:2018
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Pontificia Universidad Javeriana
  • Materias:Parásitos Células Ácido ribonucleico (ARN) Proteínas Protozoos
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