En este estudio se exploraron las comunidades arqueas en suelos salino-alcalinos extremos del antiguo lago de Texcoco, México, con conductividades electrolíticas (CE) que van de 0.7 a 157.2 dS/m y pH de 8.5 a 10.5. Las comunidades arqueas del suelo de 0,7 dS/m y pH 8,5 presentaron los valores más bajos de diversidad alfa y estuvieron dominadas por un número limitado de filotipos pertenecientes al Candidatus Nitrososphaera mesófilo. La diversidad y la riqueza de especies fueron mayores en los suelos con CE entre 9,0 y 157,2 dS/m. La mayoría de las OTU detectadas en el suelo hipersalino eran miembros de la familia Halobacteriaceae. Se detectaron nuevas ramas filogenéticas de la clase Halobacteriales en el suelo, y de forma más abundante en el suelo con el pH más alto (10,5), lo que indica que en este suelo pueden encontrarse Archaea desconocidas y no caracterizadas. Se identificaron trece géneros diferentes de la familia Halobacteriaceae y se distribuyeron de forma diferente entre los suelos. Halobiforma, Halostagnicola, Haloterrigena y Natronomonas se encontraron en todas las muestras de suelo. Las archaeas metanogénicas sólo se encontraron en suelos con pH entre 10,0 y 10,3. Las arqueas metanogénicas recuperadas pertenecían a los órdenes Methanosarcinales y Methanomicrobiales. La comparación de las estructuras de las comunidades de arqueas teniendo en cuenta la información filogenética (distancias UniFrac) agrupó claramente las comunidades por pH.
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