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Screening of polyketide genes from Brazilian Atlantic Forest soilCribado de genes de policétidos del suelo de la Mata Atlántica brasileña

Resumen

El suelo es una gran fuente de microorganismos con potencial para producir compuestos bioactivos. Dado que la mayoría de ellos no pueden cultivarse, la metagenómica se ha convertido en una herramienta útil para evaluar este potencial. El objetivo de este estudio fue cribar genes de policétidos biosintéticos (PKS) presentes en una biblioteca metagenómica construida a partir de una muestra de suelo aislada de la Mata Atlántica brasileña. La biblioteca comprende 5000 clones con inserciones de ADN entre 40 y 50 Kb. La caracterización de los grupos de genes biosintéticos de estas moléculas es una alternativa prometedora para dilucidar el potencial biotecnológico de los compuestos bioactivos en las comunidades microbianas. Los genes PKS se cribaron usando cebadores degenerados. Se aislaron los clones positivos para los sistemas PKS y se analizaron sus secuencias de nucleótidos con herramientas bioinformáticas. El cribado produjo dos clones positivos para los genes PKS II. Además, se observaron variaciones en las secuencias de los genes PKS II de la biblioteca metagenómica cuando se compararon con las secuencias de las bases de datos de cetosíntesis. Con estos hallazgos, obtenemos información sobre la posible relación entre nuevos genes biosintéticos y la producción de nuevos metabolitos secundarios.

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Información del documento

  • Titulo:Screening of polyketide genes from Brazilian Atlantic Forest soil
  • Autor:Burbano Rosero, Edith Mariela; Castillo Arteaga, Roger David; Ichiwaki, Simone; Massini, Karen; Maza Garrido, Leandro; Padilla, Gabriel
  • Tipo:Artículo
  • Año:2017
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Pontificia Universidad Javeriana
  • Materias:Genes Cultivos y suelos Bioquímica Genética molecular Microorganismos
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