La metanogénesis puede representar un proceso clave en las fases terminales de la mineralización anaeróbica de la materia orgánica en los sedimentos de las lagunas costeras. El objetivo del presente trabajo fue estudiar la dinámica temporal y espacial de las arqueas metanogénicas en sedimentos de lagunas costeras tropicales y su relación con los cambios ambientales para determinar cómo éstos influyen en la comunidad metanogénica. Se recogieron muestras de sedimentos durante las estaciones seca (febrero, mayo y principios de junio) y lluviosa (julio, octubre y noviembre). El análisis microbiológico incluyó la cuantificación de archaea metanogénica (AM) viable con tres sustratos y la evaluación de la actividad cinética del acetato en presencia y ausencia de sulfato. Las variables ambientales evaluadas fueron la temperatura, el pH, el Eh, la salinidad, el sulfato, el contenido en sólidos, el carbono orgánico y los carbohidratos. La abundancia de MA fue significativamente mayor en la estación lluviosa (106-107 células/g) en comparación con la estación seca (104-106 células/g), siendo el metanol un sustrato importante. A nivel espacial, se detectaron MA en las dos capas analizadas, y no se observaron variaciones importantes ni en la abundancia ni en la actividad de los MA. La salinidad, el sulfato, los sólidos, el carbono orgánico y el Eh fueron las variables ambientales relacionadas con la comunidad metanogénica. Se propone un modelo conceptual para explicar la dinámica de los MA.
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