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Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de B-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicosBioinformatics model design for the detection, identification and classification of ï¢-lactamases genes, as a tool for crossing molecular data with clinical data

Resumen

El seguimiento epidemiológico y farmacológico de la resistencia a antibióticos b-lactámicos mediada por la presencia de b-lactamasas requiere identificación precisa, lo cual es posible mediante la secuencia del gen, que es identificado con herramientas bioinformáticas que se incorporan a sistemas de información. Para implementar un prototipo de sistema de información que permite clasificar secuencias de genes de b-lactamasas producidas por microorganismos resistentes aislados en hospitales y realizar su cruce con los datos clínicos, se obtuvieron las secuencias de b-lactamasas reportadas a escala mundial en la base de datos Uniprot utilizando el sistema de recuperación de secuencias (SRS) del Instituto Europeo de Bioinformática (EBI), se diseñó un sistema de datos moleculares y clínicos usando “Unified Modeling Language†(UML), y se generó un modelo implementado en un servidor con sistema operativo UNIX, gestor de bases de datos MySQL para realizar la creación de la base de datos y lenguajes de programación Perl y PHP para implementar programas y cruzar datos. El sistema de información BLA_ID_CLINIC permite hacer el cruce de datos moleculares y clínicos, de tal forma que se puedan identificar las b-lactamasas de microorganismos resistentes en hospitales y hacer un seguimiento del manejo de los antibióticos y el comportamiento epidemiológico, modelo bioinformático permanentemente actualizado, disponible a través de Internet en http://bioinf.ibun.unal.edu.oc/BLA_ID_CLINIC.

  • Tipo de documento:Artículo
  • Formato:pdf
  • Idioma:Español
  • Tamaño:1335 Kb

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Información del documento

  • Titulo:Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de B-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos
  • Autor:Barreto Hernandez, Emiliano; Reguero Reza, María Teresa
  • Tipo:Artículo
  • Año:2007
  • Idioma:Español
  • Editor:Universidad Nacional de Colombia
  • Materias:Genes Enzimas Biología molecular
  • Descarga:3

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