La tuberculosis es un grave problema de salud pública, especialmente en África y Asia. Faltan estudios que describan la diversidad de cepas en la región sudafricana de Free State. El objetivo del estudio era describir la diversidad de familias de cepas de Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis) en la provincia sudafricana de Free State. Un total de 86 cepas de M. tuberculosis fueron genotipadas mediante espoligotipado. Se utilizó una tipificación de 12 locus de unidades repetitivas intercaladas de micobacterias y repeticiones en tándem de número variable (MIRU-VNTRs) para caracterizar mejor los grupos de espoligotipado resultantes. SITVITWEB identificó 49 patrones diferentes con asignación a seis linajes, entre ellos el Latinoamericano-Mediterráneo (LAM) (18 aislados), T (14 aislados), Pekín (cinco aislados), S (seis aislados), Haarlem (un aislado) y X (cinco aislados), mientras que se identificaron 37 (43,0%) huérfanos. Ocho clusters incluían 37 aislados con espoligotipos idénticos (2 a 13/cluster). La tipificación MIRU-VNTR diferenció además tres conglomerados de espoligotipos: SIT1/Beijing/MIT17, SIT33/LAM3/MIT213, y confirmó uno SIT34/S/MIT311. Además, la asignación SpolDB3/RIM de las cepas huérfanas dio lugar a otras 10 familias LAM y 13 T. En total, LAM (28 aislados) y T (27 aislados) causan el 63% de los casos individuales de MTB en nuestro estudio. El Estado Libre tiene una población de TB muy diversa en la que predomina la LAM. Se justifica la realización de nuevos estudios que incluyan cepas multirresistentes con muestras de mayor tamaño.
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