Durante 1995, 2001, 2003, 2004 y 2007 estudiamos la variación temporal en la estructura de un ensamblaje de elasmobranquios a lo largo de la costa pacífica colombiana. Para ello utilizamos los índices de diversidad, heterogeneidad, equitatividad y composición de especies, así como el tamaño promedio de capturas y los niveles tróficos promedio. Se colectó un total de 1711 especímenes de 19 especies (7 tiburones y 12 rayas) durante 90 operaciones de pesca de arrastre. El número de especies capturadas varió entre 7 (1995) y 12 (2007), lo cual demuestra una tendencia hacia un desbalance en los atributos del ensamblaje. En 1995 el nivel trófico promedio (TLm) del ensamblaje fue de 3.60, pero en 2001 disminuyó a 3.55, cuando estuvo ausente el nivel funcional de grandes predadores (TL ≥ 4). Estos resultados sugieren cambios en la composición de especies y en los atributos estructurales, y una reducción del nivel funcional superior. Se encontraron también alteraciones en las proporciones de captura, como una mayor abundancia de rayas de niveles tróficos inferiores. Este estudio sugiere un efecto de la pesca de arrastre en la estabilidad de este ecosistema tropical costero.