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Integrated Bioinformatic Analysis Identifies Networks and Promising Biomarkers for Hepatitis B Virus-Related Hepatocellular CarcinomaEl análisis bioinformático integrado identifica redes y biomarcadores prometedores para el carcinoma hepatocelular relacionado con el virus de la hepatitis B

Resumen

La infección crónica por el virus de la hepatitis B (VHB) está reconocida desde hace tiempo como un factor de riesgo dominante del carcinoma hepatocelular (CHC) y es responsable de al menos la mitad de los casos de CHC en todo el mundo. Sin embargo, el mecanismo molecular subyacente del CHC vinculado al VHB no se ha dilucidado por completo. En este trabajo, tres conjuntos de datos de microarrays, que contenían en total 170 muestras tumorales y 181 tejidos normales adyacentes procedentes del hígado de pacientes con CHC relacionado con el VHB y reunidos a partir de la base de datos Gene Expression Omnibus (GEO), fueron sometidos a un análisis integrado de genes expresados de forma diferencial (DEG). Posteriormente, se llevó a cabo el análisis de la función y el enriquecimiento de la vía, así como la red de interacción proteína-proteína (PPI). Los diez genes centrales seleccionados de la red PPI se sometieron además a un perfil de expresión y a un análisis de supervivencia. En total, se identificaron 329 DEG (67 regulados al alza y 262 regulados a la baja). Los diez DEG con el mayor grado de conectividad incluían la quinasa dependiente de ciclina 1 (CDK1), la ciclina B1 (CCNB1), la ciclina B2 (CCNB2), la quinasa de unión a PDZ (PBK), el ensamblaje anómalo de microtúbulos del huso (ASPM), ciclo de división nuclear 80 (NDC80), aurora quinasa A (AURKA), proteína diana para la proteína 2 similar a la kinesina de xenopus (TPX2), miembro 2C de la familia de la kinesina (KIF2C) y proteína F del centrómero (CENPF). El análisis de Kaplan-Meier reveló que los niveles de sobreexpresión de KIF2C y TPX2 eran relevantes tanto para la mala supervivencia global como para la supervivencia sin recaída. En resumen, los genes centrales validados en el presente estudio pueden proporcionar dianas prometedoras para el diagnóstico, pronóstico y tratamiento del CHC asociado al VHB. Además, nuestro trabajo descubre varios componentes biológicos cruciales (p. ej., el exosoma extracelular) y vías de señalización que participan en la progresión del CHC inducido por el VHB, sirviendo al conocimiento exhaustivo de los mecanismos relativos al CHC relacionado con el VHB.

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