El microbioma humano comprende bacterias, arqueas, virus y eucariotas que residen dentro y fuera de nuestro cuerpo. Estos organismos influyen en la fisiología humana, tanto en la salud como en la enfermedad, contribuyendo a mejorar o deteriorar las funciones metabólicas e inmunitarias. Los microorganismos colonizan diversos lugares del cuerpo humano, donde se adaptan a las características específicas de cada nicho. Los anaerobios facultativos predominan en el tracto gastrointestinal, mientras que los aerobios estrictos habitan en el tracto respiratorio, la cavidad nasal y la superficie cutánea. Los organismos autóctonos del cuerpo humano están bien adaptados al sistema inmunitario, debido a la interacción biológica de los organismos con el sistema inmunitario a lo largo del tiempo. La alteración de la comunidad microbiana intestinal desempeña un papel importante en la salud humana y en la patogénesis de las enfermedades. Estas alteraciones son consecuencia del estilo de vida y de la presencia de una enfermedad subyacente. La disbiosis aumenta la susceptibilidad del huésped a las infecciones, cuya naturaleza depende del lugar anatómico afectado. La diversidad única de la microbiota humana explica las actividades y funciones metabólicas específicas de estos microorganismos dentro de cada localización corporal. Por lo tanto, es importante comprender la composición microbiana y las actividades del microbioma humano, ya que contribuyen a la salud y la enfermedad.
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