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The Whole Genome Assembly and Comparative Genomic Research of Thellungiella parvula (Extremophile Crucifer) MitochondrionEnsamblaje del genoma completo e investigación genómica comparativa de la mitocondria de Thellungiella parvula (crucífera extremófila)

Resumen

Se han determinado las secuencias nucleotídicas completas del genoma mitocondrial (mt) de una especie extremófila Thellungiella parvula (T. parvula) con una longitud de 255.773 pb. El genoma mt de T. parvula es una secuencia circular y contiene 32 genes codificadores de proteínas, 19 genes de ARNt y tres genes de ARN ribosómico con una secuencia de 11,5 oding. La composición de bases de 27,5 , 27,5% T, 22,7 , y 22,3% G en orden descendente muestra un ligero sesgo de 55 T. Se identificaron 53 repeticiones en el genoma mitocondrial de T. parvula, incluidas 24 repeticiones directas, 28 repeticiones en tándem (TR) y una repetición palindrómica. Además, se han extraído un total de 199 microsatélites perfectos con un alto contenido de A/T (83,1%) mediante el análisis de repeticiones de secuencias simples (SSR) y se distribuyeron de forma desigual en este genoma mitocondrial. También analizamos la evolución de otros genomas mitocondriales de plantas en general, proporcionando pistas para la comprensión de la evolución de los genomas de orgánulos en las plantas. En comparación con otras especies de Brassicaceae, T. parvula está emparentada con Arabidopsis thaliana, cuyos caracteres de resistencia a bajas temperaturas han sido bien documentados. Este estudio proporcionará importantes herramientas genéticas para la investigación de otras especies de Brassicaceae y mejorará el rendimiento de plantas de importancia económica.

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