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A CDFT-Based Computational Peptidology (CDFT-CP) Study of the Chemical Reactivity and Bioactivity of the Marine-Derived Alternaramide CyclopentadepsipeptideEstudio computacional peptídico basado en CDFT (CDFT-CP) de la reactividad química y la bioactividad de la alternaramida ciclopentadepsipéptido de origen marino

Resumen

La alternaramida es un pentadepsipéptido cíclico aislado de fuentes marinas que ha demostrado presentar una débil actividad antibiótica frente a Bacillus subtilis y Staphylococcus aureus, así como efectos inhibitorios sobre la expresión de mediadores inflamatorios. Así, en este trabajo se reportan los resultados de un estudio computacional de las propiedades de reactividad química y bioactividad de este ciclopentadepsipéptido considerando una metodología de peptidología computacional basada en CDFT (CDFT-CP) que resulta de la combinación de los descriptores de reactividad química que surgen de la teoría funcional de la densidad conceptual (CDFT) junto con algunas herramientas quimioinformáticas que pueden ser utilizadas para estimar los parámetros fisicoquímicos asociados, mejorar el proceso de cribado virtual mediante una búsqueda de similitudes, e identificar la capacidad del péptido para comportarse como un fármaco potencialmente útil, complementado con un análisis de sus índices de bioactividad y farmacocinética relacionados con las características ADMET (absorción, distribución, metabolismo, excreción y toxicidad). Los resultados representan una nueva confirmación de la superioridad del funcional de densidad MN12SX en el cumplimiento de los teoremas de Janak y de la energía de ionización mediante el procedimiento KID propuesto. Esto ha sido útil para la predicción precisa de los descriptores de reactividad CDFT que ayudan a comprender la reactividad química. El estudio farmacocinético computacional reveló la capacidad potencial de la alternaramida como fármaco terapéutico al interaccionar con ligandos GPCR e inhibidores de proteasas. Los índices ADMET confirman esta afirmación por la ausencia de toxicidad y las buenas propiedades de absorción y distribución.

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  • Idioma:Inglés
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