Resumen

Se han detectado variantes topológicas de estructuras de ADN monocatenario (ssADN), denominadas "ADN funcional", en regiones reguladoras de muchos genes y se cree que afectan a la expresión génica. Dos análogos fluorescentes de la desoxicitidina, el pirrolo-dC (PdC) y la 1,3-diaza-2-oxofenoxazina (tC°), pueden incorporarse al ADN. Aquí describimos estudios espectroscópicos de ambos análogos para determinar propiedades fluorescentes que informen sobre transiciones estructurales de ADN de doble cadena (dsADN) a ssADN, una vía común en la transición a estructuras funcionales de ADN. Obtuvimos espectros de dicroísmo circular detectado por fluorescencia (FDCD), espectros de fluorescencia en estado estacionario y tiempos de vida de fluorescencia de los fluoróforos en el ADN. Nuestros resultados muestran que el PdC es ventajoso en los estudios de tiempo de vida de fluorescencia debido a un cambio distinto de ~2 ns entre bases apareadas y no apareadas. Sin embargo, el tC° es una mejor sonda para los experimentos FDCD que informan sobre la estructura helicoidal del ADN que rodea al fluoróforo. Ambos fluoróforos proporcionan datos complementarios para medir las transiciones estructurales del ADN.

• Materias:Ingeniería genética Ácido desoxirribonucleico (ADN) Ácido ribonucleico (ARN) Pliegue de Proteína Genómica
• Subjects:Genetic engineering Deoxyribonucleic acid (DNA) Ribonucleic acid (RNA) Protein Folding Genomics
• Palabras claves:adn, cadena de adn, transiciones estructurales, estudios del tiempo de vida de la fluorescencia, estructuras funcionales de adn, espectros de fluorescencia de estados, pdc, fluoróforos, ssdna, experimentos fdcd
• Keywords:dna, strand dna, structural transitions, fluorescence lifetime studies, functional dna structures, state fluorescence spectra, pdc, fluorophores, ssdna, fdcd experiments