El petróleo es la principal matriz energética del mundo cuyo refinado genera subproductos químicos que pueden dañar el medio ambiente. Entre esos residuos, los hidrocarburos aromáticos policíclicos (HAP) se consideran contaminantes persistentes. Dieciséis de ellos se consideran prioritarios para la remediación, y entre ellos se encuentra el benzo(a)pireno. Entre las técnicas de remediación destaca la biorremediación. El género Burkholderia figura entre los microorganismos conocidos por su capacidad para degradar compuestos persistentes; sus cepas se utilizan como modelos para estudiar dicha capacidad. La secuenciación de alto rendimiento permite a los investigadores alcanzar un conocimiento más amplio sobre la biodegradación por bacterias. Mediante el análisis de transcritos y ARNm se pueden detectar las regiones genómicas implicadas en esta aptitud. Para desentrañar estos procesos, utilizamos la cepa modelo G4 de B. vietnamiensis en dos grupos experimentales: uno fue expuesto a benzo(a)pireno y el otro (control) no. Se generaron seis transcriptomas de cada grupo con el objetivo de comparar la expresión génica e inferir qué genes están implicados en las vías de degradación. Ciento cincuenta y seis genes se expresaron de forma diferencial en el grupo expuesto al benzo(a)pireno, de los cuales 33
están implicados en la actividad catalítica. Entre ellos, las regiones genómicas más significativas fueron la proteína de degradación del ácido fenilacético paaN, implicada en la degradación de compuestos orgánicos para obtener energía; la subunidad de unión a FAD de la oxidorreductasa, relacionada con la regulación de electrones dentro de grupos de enzimas dioxigenasas con potencial para escindir anillos bencénicos; y la deshidrogenasa, descrita como responsable de la degradación del fenol. Estos datos sientan las bases para comprender la biorremediación del benzo(a)pireno y las posibles aplicaciones de esta cepa en entornos contaminados.
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