El dinoflagelado marino Cochlodinium polykrikoides es responsable de la proliferación de algas nocivas en medios acuáticos y se ha extendido por los océanos de todo el mundo. Como microeucariota, parece tener características genómicas distintas, como la estructura y la regulación de los genes. En el presente estudio, caracterizamos la proteína de choque térmico (HSP) 70/90 de C. polykrikoides y evaluamos sus respuestas transcripcionales al estrés ambiental. Ambas HSP contenían los patrones de motivos conservados, mostrando la mayor homología con las de otros dinoflagelados. El análisis genómico mostró que la CpHSP70 no tenía intrón, sino que estaba codificada por disposición en tándem con separación de espaciadores intergénicos. Sin embargo, CpHSP90 tenía un intrón en las regiones genómicas codificantes, y no se encontró ninguna región intergénica. Los análisis filogenéticos de las HSP separadas mostraron que CpHSP70 estaba estrechamente relacionada con el dinoflagelado Crypthecodinium cohnii y CpHSP90 con otros Gymnodiniales en dinoflagelados. Los análisis de expresión génica mostraron que ambos genes HSP estaban regulados al alza por los tratamientos de alguicidas separados CuSO4 y NaOCl; sin embargo, mostraban un patrón de regulación a la baja con el tratamiento con PCB. La transcripción de CpHSP90 y CpHSP70 mostró patrones de expresión similares bajo el mismo tratamiento tóxico, lo que sugiere que ambos genes podrían tener funciones cooperativas para la regulación génica inducida por tóxicos en el dinoflagelado.
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