Resumen

Antecedentes. La evidencia acumulada muestra que el sistema inmune innato es un actor clave en la reparación y regeneración cardiovascular, pero poco se sabe sobre el papel de los genes relacionados con el sistema inmune (IRGs) en la cardiomiopatía hipertrófica (MCH). Métodos. Los perfiles de expresión diferencial de ARNm de las muestras de MCH se descargaron del conjunto de datos Gene Expression Omnibus (GEO) (GSE89714), y el perfil de expresión de IRG se obtuvo de la base de datos ImmPort. Las vías reguladoras de los IRG en la MCH se investigaron mediante el análisis de genes discrepantemente expresivos (DEG), el análisis de enriquecimiento de la función/vía génica y la red de interacción proteína-proteína (PPI). Además, se seleccionaron los IRG centrales en la red PPI para la predicción de fármacos. Resultados. Un total de 854 genes fueron expresados diferencialmente en la MCH, de los cuales 88 eran IRGs. El análisis de enriquecimiento funcional reveló que 88 IRGs estaban principalmente implicados en los procesos biológicos (BP) de la vía de la proteína SMAD, la proliferación de células musculares lisas, la proteína serina/treonina quinasa, y la cascada de la proteína quinasa activada por mitógenos (MAPK). La interacción citoquina-receptor de citoquinas, la vía de señalización TGFβ, la vía de señalización PI3K-Akt y la vía de señalización MAPK se enriquecieron en el análisis de enriquecimiento de vías de estos 88 IRG. Además, se construyó la red reguladora PPI de IRGs, y se seleccionaron 10 IRGs centrales para construir una red reguladora para HCM. 4 factores de transcripción (TFs) fueron los principales reguladores de 10 IRGs. Por último, se introdujeron estos 10 IRG centrales en la base de datos farmacogenómica para su predicción y se obtuvieron los fármacos pertinentes. Conclusiones. En este estudio, 10 IRGs hub fueron coexpresados con 4 TFs para construir una red reguladora para HCM. La predicción de fármacos de estos 10 IRGs centrales propuso agentes terapéuticos potenciales que podrían utilizarse en la MCH. Estos resultados indican que los IRGs son reguladores potenciales y dianas terapéuticas farmacológicas en la MCH.

• Materias:Análisis electroquímico Nanotecnología Nanoestructuras Nanocompuestos Nanotubos
• Subjects:Electrochemical analysis Nanotechnology Nanostructures Nanocomposites Nanotubes
• Palabras claves:hub irgs, hcm, irgs, red reguladora, vía, perfiles de expresión mrna diferenciales, proliferación de células musculares lisas, análisis de enriquecimiento funcional, omnibus de expresión génica, perfil de expresión irg
• Keywords:hub irgs, hcm, irgs, regulatory network, pathway, differential mrna expression profiles, smooth muscle cell proliferation, functional enrichment analysis, gene expression omnibus, irg expression profile